Mengacu pada peraturan Rektor UGM Nomor 11 Tahun 2016 tentang Pendidikan Pascasarjana, Prodi Magister Rancang Kota menggunakan sistem SKS dengan detail tiap semester sebagai berikut.
| SEMESTER | MATA KULIAH | SKS |
| 1
(12 SKS) |
Teori Rancang Kota | 2 |
| Metode Rancang Kota | 2 | |
| Prinsip dan Standar Rancang Kota | 2 | |
| Studio Rancang Kota: Eksplorasi Dasar | 6 | |
| Jumlah SKS Semester 1 | 12 | |
| 2
(14 SKS) |
Permasalahan Rancang Kota | 2 |
| Tata Kelola Rancang Kota | 2 | |
| Studio Rancang Kota: Eksplorasi Komprehensif | 6 | |
| Metode Penelitian Rancang Kota | 2 | |
| Mata Kuliah Pilihan 1 | 2 | |
| Jumlah SKS Semester 2 | 14 | |
| 3
(6 SKS) |
Pra-Tesis Rancang Kota | 2 |
| Mata Kuliah Pilihan 2 | 2 | |
| Mata Kuliah Pilihan 3 | 2 | |
| Jumlah SKS Semester 3 | 6 | |
| 4
(8 SKS) |
Tesis Rancang Kota | 8 |
| Jumlah SKS Semester 4 | 8 | |
| Jumlah SKS Total | 40 | |
